La Atari 1040ST es una computadora de 16bits, mejora de la
Atari 520ST
, cuyo lanzamiento al mercado se realizó en 1987 a un precio aproximado de 1000 dólares americanos.
Tiene las mismas características generales que su predecesora, salvo por el incremento a 1MB de su memoria RAM y, al igual que en la versión E de la Atari 520ST, la incorporación en su carcaza un drive de 3.5" y la fuente de alimentación.
La Atari 1040ST viene de forma estándar con 1 MB de RAM 1 196 kB de memoria ROM, dos puertos MIDI (uno de entrada y otro de salida) y un puerto para cartridge de 40 pines para software en ROM. Además de un puerto serie (una reducida implementación de RS232), uno paralelo unidireccional para impresoras, un puerto para discos rígidos propietarios, conector para una disquetera externa y otro para un monitor RGB analógico.
El sistema operativo fue llamado TOS (Tramiel Operating System) incluído en ROM para una rápida carga. El software de escritorio (GEM) es de la autoría de Digital Research Inc. tratándose de una interfaz de usuario (GUI) basada en iconos. La versión 1040STe (enhanced) se lanzó al mercado en noviembre de 1989.